رسالة ماجستير في كلية تكنولوجيا المعلومات تناقش تحديد العلاقة بين عوامل النسخ والتعابير الجينية باستخدام تقنيات تعدين البيانات

التاريخ :06/05/2020 20:38:26
كلية تكنولوجيا المعلومات
كتـب بواسطـة  حسين علي العميدي عدد المشاهدات 238

نوقشت في كلية تكنولوجيا المعلومات رسالة الماجستير للطالب (امير علي كاظم) قسم البرمجيات والموسومة  (تحديد العلاقة بين عوامل النسخ والتعابير الجينية باستخدام تقنيات تعدين البيانات) وبإشراف الدكتورة سرى زكي ناجي الراشد. حيث بينت الرسالة طريقـة تعتمـد علـى الموديـل لتحديـد العلاقـة بيـن عوامـل النسـخ و التعابير الجينـية. كما واشار البحث الى التطور السريع للتكنولوجيا والذي أدى إلى ظهور (تكنولوجيا الميكروأري) التي  لها القدرة على دراسة التعبير الجيني, وان الهدف الرئيسي من الرسالة هو بناء نموذج لتحديد التفاعل (العلاقة) بين الجينات وعوامل النسخ من خلال اختيار مجموعة فرعية من الجينات ذات الصلة من مجموعة البيانات الأصلية. تكون البحث المقترح من ثلاث مراحل رئيسية : اختيار الجينات ، التجميع (العنقدة) ومرحلة التنبؤ. تم إنجاز عملية تقليل عبئ الاحتساب المساحة الحسابية باستخدام طريقة تصفية المعلومات المتبادلة المقترحة لاختيار الجينات بالاعتماد على بيانات التعبير الجيني. في التجميع ، يتم تحديد العلاقات بين مجموعة من الجينات ومجموعة من عوامل النسخ عن طريق تقسيم بيانات التعبير الجيني إلى مجموعة من العناقيد ومقارنة تطبيق ثلاث تقنيات تجميع مختلفة، بما في ذلك: k-Means و DBSCAN و Mean Shift. بالإضافة إلى ذلك استخدام بعض الطرق للـ k-Means ، مثل طريقة الـ Elbow والـ Silhouette ، لإعطاء بعض المؤشرات لتقدير العدد المناسب من العناقيد (k). في التنبؤ, وقد تم استخدام مجموعتين من البيانات المتاحة لتحقيق أهداف البحث: بيانات التعبير الجيني لدورة خلية الخميرة ومجموعة بيانات عوامل النسخ. تم إجراء تقييم لأداء نموذج التنبؤ باستخدام MAEوRMSE. جدير بالذكران  المناقشة تمت باستخدام تطبيق ZOOM المتخصص بالاجتماعات الفيديوية، وتم انضمام احد اعضاء اللجنة الخارجيين واكماله مناقشة الطالب.  
اعلام كلية تكنولوجيا المعلومات                                                                                                                                                                                                                         





   08/07/2020 15:13:58
   07/07/2020 08:13:56
   07/07/2020 07:51:22
   05/07/2020 06:55:16
   05/07/2020 06:36:49
   09/07/2020 20:01:36
   09/07/2020 18:23:19
   09/07/2020 17:31:45
   09/07/2020 08:47:01
   08/07/2020 22:14:00