أسس مركز بابل للدراسات الحضارية والتاريخية بتاريخ 23/10/ 2008 بعد دمج مركزي - مركز وثائق ودراسات الحلة الذي أسس عام 1994ومركز الدراسات البابلية الذي أسس عام 1997 - ليصبحا تحت اسم مركز بابل للدراسات الحضارية والتاريخية،
وقد تم استحداث عدد من الشعب والوحدات في المركز في عام 2009 وكما موضح ادناه

• شعبة الدراسات الحضارية
  تضم هذه الشعبة عدداً من الوحدات ولديها كادرملاك علمي من التدريسيين والباحثين لتقديم البحوث عن مدينة الحلة الأثرية وترجمة اللغات القديمة وهذه الوحدات
  • وحدة بحوث وترجمة اللغات القديمة
    تقوم هذه الوحدة بتحليل وترجمة الكتابات في العهود التاريخية القديمة وإعداد بيانات كل ما نشر عن مدينة بابل الأثرية.
  • وحدة المتحف
    تعنى هذه الوحدة بعرض الآثار أو صورها الجبسية والتي من خلالها نطلع على حضارة وفنون بابل الأثرية وكذلك عرض صور لعلماء الحلة والمراقد وتصوير أماكنها القديمة وعرض المخطوطات الخاصة بعلماء مدينة الحلة.
• شعبة الدراسات التاريخية واللغوية والأدبية
  تضم هذه الشعبة عدداً من التدريسيين المختصين بعلوم اللغة العربية وآدابها وبالتاريخ بقسميه القديم والحديث والإسلامي ويقوم التدريسييون بتقديم البحوث وإجراء الدراسات وحسب اختصاص الوحدات.
  • وحدة الدراسات التاريخية
    تعمل هذه الوحدة على دراسة حضارة بابل القديمة وأهم الأحداث السياسية والاجتماعية والاقتصادية وكذلك دراسة تاريخ مدينة الحلة منذ تأسيسها وحتى يومنا هذا فضلاً عن دراسة الإرث الحضاري لهذه المدينة.
  • وحدة الدراسات اللغوية والأدبية
    تعمل هذه الوحدة على إيجاد قاعدة بيانات عن الدراسات اللغوية والأدبية التي تخص عهد مدينة بابل الحضارية ومدينة الحلة.
  • وحدة تحقيق المخطوطات والوثائق
    تقوم هذه الوحدة بتحقيق المخطوطات التي يحصل عليها المركز وتقديمها على شكل بحوث إلى إدارة المركز وحفظها في أرشيف المخطوطات والوثائق .
• شعبة الدراسات الفنية والعلمية
  تضم هذه الشعبة عدداً من الوحدات ويكون ملاكها من التدريسيين والباحثين والموظفين وتتكون من الوحدات التالية
  • وحدة المجلة العلمية
    وتعني بنشر البحوث لجميع التدريسيين الباحثين من داخل المركز وخارجه بعد التقييم من قبل أساتذة مختصين.
  • وحدة المكتبة والانترنيت
    وتضم وحدة المكتبة عدداً من الكتب التاريخية واللغوية والأدبية والاسلامية والتي يرتادها عدد من طلبة الدارسات الأولية والعليا بمختلف الاختصاصات ، اما بالنسبة الى وحدة الانترنيت فتعمل على مساعدة الباحثين في الحصول على مصادر المعلومات عن مختلف العلوم والتاريخ والأدب والأعلام ، وتعمل هذه الوحدة على إنشاء مكتبة إلكترونية تحوي على مجموعة من المصادر المهمة.
  • وحدة الإدارة والخدمات
    تضم هذه الوحدة عدداً من الموظفين الذين يعملون على تحرير الكتب والإجابة عليها وتنظيم العمل الإداري ومتابعة حضور وانصراف موظفي المركز وانصرافهم ،فضلاً عن الخدمات الأخرى.
• شعبة الدراسات الإعلامية واستطلاع الرأي
  تعمل هذه الشعبة على إجراء الدراسات الإعلامية والبحوث واستطلاع الرأي على أهم الأحداث في الوقت الحاضر.
• وحدة الحسابات
  تضم هذه الوحدة عدداً من الموظفين الذين يعملون على تنظيم الرواتب وأجور المحاضرات البحثية وتوزيعها ومتابعة الأعمال الحسابية وشراء المواد والأجهزة للمركز وإدخالها مخزنياً وإدراجها بذمة المركز.